唐前属鄮县,鄞州。

唐开元二十六年（738），以舟山群岛置翁山县，属翁山县安期乡。

大历六年（771）翁山县废，属余姚郡鄮县。

五代后梁开平三年（909），改鄮县为鄞县，属鄞县。

北宋熙宁六年（1073），在旧翁山县地建昌国县，属昌国县安期乡三山里。

元因之。

洪武十九年（1386），朝廷实行""海禁""政策，强徙岛民入内地，次年昌国县废，改属定海县（今宁波市镇海和北仑）。

清顺治十三年（1656）十月，朝廷再次强迁岛民入内地。

清康熙二十七年（1688），以旧昌国县地建定海县，属定海县安期乡，有法雨,吉祥,飞沙,梵岙,后岙,虓虎6岙。

清道光二十一年（1841），置定海直隶厅安期乡洛迦庄。

宣统二年（1910），筹办城,镇乡地方自治，属定海直隶厅洛舵乡。

民国初沿袭清制。

1919年，改编城镇,乡自治，协和乡属定海第七。

1934年，划分为定海县第五桃一,桃二,桃三,桃四,桃五5个乡，1935年合并第五桃花乡，1936年撤设乡镇联合办事处，属第四办事处。

1945年后为六横桃花乡。

1949年改设为六桃桃花乡。

1934年建普陀山乡，属定海县第二，为普陀山建乡之始。

1945年改为定海县普陀普陀山乡，1946年又改为定海县沈家门普陀山乡。

1950年5月解放，仍属定海县沈家门普陀山乡。

1953年4月，以舟山群岛成立舟山专，建普陀县，属普陀县普陀。

1956年，起直隶于普陀县。

1958年10月，改建为舟山县东海公社普陀山大队，1959年1月，设沈家门公社普陀山管理。

1961年10月，建舟山县普陀普陀山人民公社。

1962年5月，舟山专恢复，复属普陀县。

1963年，葫芦岛从普陀山乡析出，成立葫芦乡人民公社。

1984年，撤销人民公社，改建为普陀山乡。

1989年，撤普陀山乡，改建普陀山镇，镇政府驻磐陀庵（梅岑路119号）。

名称沿用至今。