清初，为马书伙目地，后为归治里头甲地。

民国二十八年（1939年），为四辖地。

民国二十九年（1940年），废，扩大乡镇，改镇。

1950年，属包谷垴。

1953年，由包谷垴划出成立杨梅山。

1962年，夏改杨梅山。

1963年，杨梅山,河桥,水磨,黄草坪,白沙地,白龙磨,地得卡,树补8小公社划归东川市（今会泽县），改称马树。

1969年，改马树公社。

1984年，复称马树。

1988年，改为马树乡。

划出炉房,噜布,荒田,鸡噜,鲁德等5村加上新建的底里村另置炉房乡。

2002年9月，成立马树镇。