战国时期，本镇属燕国。

公元446年，北魏王朝拓拔氏入主幽州，濒海地因海侵人口锐减，村落荒废，朝廷提出“凡不足百户县者罢之”，鼓睦镉醒�泥瓦工培训培训班,澳睦镉醒�泥瓦工培训培训班,泉州入雍奴”，该地属雍奴县所辖。

唐天宝元年（742），雍奴县更名武清，高村属武清县。

宋辽对峙时期，高村属辽国，金朝与南宋对峙时期，高村地属金朝武清县。

元朝属漷州。

明初，高村属顺天府。

燕王扫北，本镇村庄又增多四村。

清朝乾隆七年武清县县境全图记载，高村镇域属通州管辖。

1937年日寇侵占武清后改编为乡制。

1939年分别属于武清县第一利尚屯乡和第二高村乡和牛镇乡。

1940年实行县公署乡制，本镇属武清第二被编为两个乡，牛镇乡和高村乡。

1948年11月份解放，属武清第六，1949年调整划，改为第四，1950年8月改称第三，1952年改称第八，1957年撤并乡建高村乡。

2013年6月撤乡建镇为武清高村镇。