北宋时期设镇治，石门镇辖原归郯城县。

1940年初，西部一度属临沭县。

1942年，划归郯城县。

东部属江苏哪里有学泥瓦工培训培训班,海陵县（后改为东海县）。

1953年9月，将东海县第八,第九和郯城县第九各一部划入，建立临沭县第十一，设址石门。

1956年10月，划归郯城县，时称石门。

1961年，复归临沭县，称石门公社。

1962年4月，改为石门。

1969年3月，改为石门公社。

1970年11月，改为石门。

1971年1月，改为石门人民公社。

1984年12月，撤公社，设石门镇和前庄乡。

1995年8月，撤前庄乡，设前庄镇。

2001年7月，石门镇和前庄镇合并为石门镇。