地名由来：

“巴丹吉林”系蒙古语，“巴丹”是由巴岱（人名）演变而来，“吉林”（吉仁音译）是数词，即“六十”。几百年前，有一名叫巴岱的牧民居住在巴丹吉林沙漠的大沙山旁，发现60个大小不一的海子，后人为纪念他故称巴丹吉林沙漠。巴丹吉林镇因辖内著名的巴丹吉林沙漠而得名。

荣誉排行：

2022年6月，巴丹吉林镇被授牌命名为平安内蒙古建设示范苏木乡镇（街道）。

2019年10月，2019年度全国综合实力千强镇榜单公布，巴丹吉林镇位列第361名。

2020年9月，巴丹吉林镇上榜2019中国西部百强镇，位列第83位。

2016年1月，巴丹吉林镇入选第三批美丽宜居小镇示范名单。

2015年7月，巴丹吉林镇入选第三批全国特色景观旅游名镇名村示范名单。

2014年7月，巴丹吉林镇被国家住房城乡建设部等七部委确定为全国重点镇。

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巴丹吉林镇，即内蒙古自治阿拉善右旗政府所在地，阿拉善右旗政治,经济,文化和社会活动中心。原名额肯呼都格镇，几年来，随着改革开放和社会经济的日益发展，巴丹吉林镇已成为集工业,农业,交通,服务业为一体的新型城镇。

2011年5月24日，根据内政字[2011]143号《内蒙古自治人民政府关于阿拉善右旗额肯呼都格镇更名为巴丹吉林镇的批复》，阿盟阿右旗旗府所在地额肯呼都格镇被批复更名为巴丹吉林镇。

废止的旧地名“额肯呼都格”系蒙古语，意为“上井子”或“第一个井”。1961年5月25日，阿右旗正式成立，党政机关驻呼和达布苏（今雅布赖盐化公司旧址）；1965年9月，阿右旗将旗府所在地迁至额肯