1949年7月设巡店,深沟村系巡店管辖;1952年10月巡店调整为第二,深沟村系第二管辖;1956年3月为第三指导组,深沟村系第三指导组管辖;1958年巡店命名幸福人民公社,深沟村改为深沟大队,系幸福人民公社管辖;同年底恢复原名,深沟大队系巡店管辖;1975年撤并社为巡店人民公社,深沟大队属巡店人民公社管辖;1987年巡店撤建镇,析原巡店的辛榨乡,高店乡合并为辛榨乡。
深沟大队改名为深沟村,属辛榨乡管辖。