民国时期，今辖范围分属孝感县民生乡,同生乡,湖港镇等。

1949年5月孝感解放，设肖家港。

1951年改名为肖港。

1952年改为孝感县第十二；1953年又改称肖港。

1958年改设为肖港人民公社。

1961年改名肖港。

1967年更名为长征，后复称肖港。

1975年撤并社时改称肖港人民公社。

1984年称肖港，属县级孝感市。

1987年设肖港镇，属县级孝感市。

1993年县级孝感市撤销，设孝南，属孝南，2018年8月24日，肖港镇61个村,4个调整合并为35个村,4个，沿用至今。