明代建村。

1958年称万古人民公社东妹大队,中妹大队,西妹大队。

1968年设置东妹大队革委会,中妹大队革委会,西妹大队革委会。

1979年恢复东妹大队,中妹大队,西妹大队。

1983年称万古乡东妹村民委员会,中妹村民委员会,西妹村民委员会。

1988年地名标准化后，称万古乡妹村东街村民委员会,妹村中街村民委员会,妹村西街村民委员会。

1996年称万古镇妹村东街村民委员会,妹村中街村民委员会,妹村西街村民委员会。

2020年，村居规模调整，东妹村,中妹村,西妹村,袁庄4个村合并调整为妹村村民委员会，仍属万古镇。