古城村在古雷城内，古雷城始建于明正统六年（1441），明正德十年（1515）重修，为古雷巡检司驻地，也称“古雷社”。

清代古雷保，1916年古雷半岛自港口以南与东山岛，组合成立东山县，1954年为古雷城下乡。

1955年11月，古雷7乡划归漳浦县辖，1958年9月属杜浔公社古雷管理城下大队，1961年7月成立古雷公社，城下大队分为城内,下垵2大队，1981年11月，为别于同名的湖西公社城内大队,旧镇公社城内大队，经批准更名为古城大队。

1984年9月，撤社建乡属古雷乡（镇）古城村，自命名起沿用至今。