唐代属闽县晋安乡海畔里。

宋代属闽县晋安东乡，里名不变。

元代，海畔里与海曲里(壶江,川石岛，现属连江县琯头镇)合并为嘉登海曲里。

明代，改为嘉登里。

清代，为闽县东南二嘉屿。

1934年属闽侯县四；1935年改属闽侯县二；实战型人民共和国成立后，1949年8月17日琅岐设闽江口军民办事处。

同年12月琅岐属闽侯县二。

1954年11月，二辖闽琅镇和衙前,三平,吴庄,海屿,云龙,金砂,凤窝,龙台,公婆等乡。

1956年6月，琅岐划归连江县，同年，10月又划归闽侯县。

1958年8月，琅岐拆并乡，改为琅岐镇；同年11月成立琅岐人民公社。

1961年11月，琅岐由闽侯县划入福州市郊。

1963年6月，琅岐设公所，辖10个人民公社,36个生产大队。

1970年，琅岐从福州市郊划入连江县。

1975年12月，从连江县划归福州市郊。

1984年，琅岐人民公社改为琅岐乡。

1991年10月，琅岐乡改为琅岐镇，辖9个管理，39个行政村，1个居民委员会。

1995年11月，琅岐镇划入福州市马尾。

2009年辖1个居委会，27个行政村。