长坑乡在隋唐时期属南安县地，在唐咸通五年（公元864）安溪始置小溪场时，则属小溪场辖地，在五代后周显德二年（955）置县时隶属清溪县，在宋宣和三年（1121年）清溪改安溪时，长坑一直属安溪县地，划为金田乡还集里（11,12都），沿用到明嘉靖元年（1522年），还集里析为还一,还二里，今长坑乡属还二里。

一直沿用到1932年10月，全县划为6个，开始设有长坑，辖还一,还二,感德,常乐4个里。

1936年7月，长坑改为第三署，领西南镇,剑义乡,感桃乡,福珊乡和蓝进乡；1941年1月，第三更名为第二；1942年4月，第二改为长康；1945年1月，长康撤销，属崇新所辖，同年10月崇新撤销，长坑设长卿镇，而今的福春,水缸,珊屏,田中,三村等村属福珊乡，祥泉村属蓝进乡。

1949年9月20日安溪县城解放，正式成立安溪县人民政府，沿用中共地下游击活动划分域，长坑设长康，辖长卿镇及蓝进,福珊,多卿,潘桃等5个乡镇，同年12月长康改为第五，辖长卿镇及尚卿,蓝进,乐德乡。

1950年4月，全县域调整，仍为第五不变，辖长坑,剑斗,感德,翰卿,龙居,温泉等6个乡镇，29个小乡。

1952年7月全县域划为14个，长坑为十一，辖13个乡镇。

1955年9月，十一改为长坑，辖17个乡，十四改为珊屏。

1956年6月，全县12个并为7个，长坑辖今长坑,蓝田,祥华,感德,桃舟等25个乡镇。

1958年2月，撤销7个公所，划为28个乡镇，长坑设长坑乡，辖6个小乡。

1958年11月，取消乡建制，全县重新调整成立9个人民公社，长坑设长坑人民公社，辖今蓝田,祥华,长坑40个大队。

1961年8月，全县域再次调整，设8个，长坑设长坑，辖14个小公社。

1965年4月，撤销建制，长坑划分为长坑,祥华2个公社，长坑公社辖30个大队。

1981年11月，长坑公社析为长坑,蓝田2个公社，长坑公社辖22个大队。

1984年7月实行政社分开，长坑公社改为长坑乡，今辖有26个村,1个居民组,1个茶场；2020年6月撤销长坑乡设长卿镇。